1. ↑ مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا، «Pie chart»، ویکی‌پدیای انگلیسی، دانشنامهٔ آزاد (بازیابی در ۲۱ تیر ۱۳۹۰).

هرم جمعیت

هرم جمعیت که هرم سن جنس و نمودار ساختار سنی نیز نامیده می‌شود توصیفی گرافیکی از توزیع رده‌های مختلف سنی از جمعیت انسانی (یک منطقه کشور و یا همه جهان) است. این توزیع معمولاً به شکل هرم است.

این هرم معمولاً از دو نمودار میله ای کنار هم قرار گرفته تشکیل شده است. جمعیت روی محور x‌ها و سن روی محور y‌ها نشان داده می شود. بنا به قرارداد جمعیت مردها در سمت چپ و زنان در سمت راست هر ستون به نمایش در می آید. ^[۱] اما معمولا در ایران آمار مردان را در طرف راست میله و آمار زنان را در طرف چپ قرار می‌دهند. ^[۲]

رده سنی [۳]	کل	مردان	زنان
00-04	6603587	3383235	3220352
05-09	6110685	3133942	2976743
10-14	6022497	3091165	2931332
15-19	7760025	3986221	3773804
20-24	9317122	4803636	4513486
25-29	8626880	4396230	4230650
30-34	7330587	3743269	3587318
35-39	5697338	2934456	2762882
40-44	4931267	2499581	2431686
45-49	3915632	1939458	1976174
50-54	3344054	1664526	1679528
55-59	2576732	1278720	1298012
60-64	1754001	837096	916905
65-69	1244213	595463	648750
70-74	1028065	492904	535161
75-79	831180	400943	430237
80-84	491733	224725	267008
85-89	246187	108290	137897
90-94	49825	19532	30293
95-99	8757	2879	5878
100+	853	231	622
همه	77891220	39536502	38354718

منابع

1. ↑ Wikipedia-Population pyramid
2. ↑ هرم سنی جمهوری اسلامی ایران؛ دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی تبریز؛ اسفند ۱۳۹۰
3. ↑ U.S. Census Bureau, International Data Base جمعیت ایران، شامل مهاجران مقیم ایران در سال

رسم نقطه‌ای

رسم نقطه‌ای(به انگلیسی: Dot Plot) یک روش گرافیکی برای مقایسه دو دنبالهٔ بیولوژیکی، به هدف پیدا کردن مناطقی که در آنها بیشترین شباهت بین دو دنباله وجود دارد میباشد.

محتویات ۱ مقدمه ۲ نمونه ۳ منابع ۴ پیوند به بیرون

مقدمه

ساده‌ترین راه برای درک شباهت بین دو دنباله پروتئینی استفاده از نوعی ماتریس شباهت است که به آن رسم نقطه‌ای می‌گوییم. رسم نقطه‌ای یک ماتریس دو بعدی است که دو دنباله پروتئینی محور‌های افقی و عمودی آن را تشکیل داده و با هم مقایسه می‌شوند و در دهه ۱۹۷۰ توسط فیلیپس معرفی شد.

یک راه ساده برای نمایش شباهت بین دو دنباله این است که در صورت یکسان بودن عنصری از محور افقی با عنصر دیگری از محور عمودی، درایه‌های متناظر با آن را در ماتریس، نقطه بگذاریم.در نتیجه بخش‌های منطبق در دنباله به صورت خط‌های مورب در ماتریس ظاهر میشوند.

بر اساس تعداد و طول بخش‌های منطبق (خط‌های مورب در ماتریس) میتوان شباهت دو دنباله را نتیجه گرفت.در ماتریس دو پروتئین عینا موسوی قطر اصلی ماتریس توسط نقطه‌ها پر میشود و هرگونه حذف و اضافه در عناصر دنباله‌ها باعث اختلال در قطر اصلی می‌گردد. علاوه بر قطر اصلی ممکن است قطر‌های دیگری در ماتریس توسط نقطه‌ها ایجاد شود که نشان دهندهٔ شباهت‌های محلی یا بخش‌های تکراری در دنباله‌است.به دلیل محدود بودن الفبای پروتئین‌ها بسیاری از بخش‌های منطبق ممکن است اتفاقی رخ داده باشند. یک راه برای کاهش انطباق‌های اتفاقی این است که فقط قطر‌های چندتایی را در ماتریس نگاه داشته، باقی را حذف کنیم (مثلا قطرهای سه تایی).این کار موثر است چون احتمال اتفاقی بودن انطباق سه عنصر پشت سر هم در دنباله، بسیار کمتر از انطباق یک عنصر است.

رسم نقطه‌ای یکی از راه‌های قدیمی مقایسه دو دنباله است که یک دنباله در محور x ‌ها و دیگری در محور y‌ها قرار میگیرند.هنگامی که دو عنصر از دنباله‌ها یکسان باشند در درایهٔ متناظر با آنها نقطه‌ای رسم می‌شود. توجه داشته باشد که دنباله‌ها میتوانند به صورت جلورو (مستقیم) یا عقبرو (معکوس) روی محورها قرار بگیرند.در این صورت هر دو دنباله باید در یک جهت انتخاب شوند. همچنین توجه داشته باشد که جهت دنباله‌ها روی محور، جهت خط‌ها را در ماتریس تعیین میکند.

ویژگی‌های خاصی مانند انتقال فریم‌ها، تکرار مستقیم و تکرار معکوس روی ارتباط بین نقاط تاثیر میگذرد. انتقال فریم‌ها شامل حذف، اضافه و جهش می‌باشد.

نمونه

مثالی از مقایسه دو دنباله پروتئینی از رسم نقطه‌ای:

1. درایه‌های متناظر با عناصر یکسان در محور‌ها نقطه گذاری شده‌اند.
2. قطرهای دوتایی و سه تایی نگاه داشته شده‌اند.
3. مسیر بهینه در ماتریس مشخص شده‌است.

منابع

• مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا، «Dot plot»، ویکی‌پدیای انگلیسی، دانشنامهٔ آزاد (بازیابی در 27 ژوئن 2011).
• http://www.scribd.com/doc/17727/complete-notes-on-Bioinformatics

پیوند به بیرون

• A tutorial
• Genomdiff — an open source Java Dot Plot program for viruses
• Gepard
• ANACON — Contact analysis of dot plots.
• General introduction to dot plots with example algorithms and a software tool to create small and medium size dot plots.
• Dotlet — provides a program allowing you to construct a dot plot with your own sequences.

رسم نقطه‌ای

رسم نقطه‌ای(به انگلیسی: Dot Plot) یک روش گرافیکی برای مقایسه دو دنبالهٔ بیولوژیکی، به هدف پیدا کردن مناطقی که در آنها بیشترین شباهت بین دو دنباله وجود دارد میباشد.

محتویات ۱ مقدمه ۲ نمونه ۳ منابع ۴ پیوند به بیرون

مقدمه

ساده‌ترین راه برای درک شباهت بین دو دنباله پروتئینی استفاده از نوعی ماتریس شباهت است که به آن رسم نقطه‌ای می‌گوییم. رسم نقطه‌ای یک ماتریس دو بعدی است که دو دنباله پروتئینی محور‌های افقی و عمودی آن را تشکیل داده و با هم مقایسه می‌شوند و در دهه ۱۹۷۰ توسط فیلیپس معرفی شد.

یک راه ساده برای نمایش شباهت بین دو دنباله این است که در صورت یکسان بودن عنصری از محور افقی با عنصر دیگری از محور عمودی، درایه‌های متناظر با آن را در ماتریس، نقطه بگذاریم.در نتیجه بخش‌های منطبق در دنباله به صورت خط‌های مورب در ماتریس ظاهر میشوند.

بر اساس تعداد و طول بخش‌های منطبق (خط‌های مورب در ماتریس) میتوان شباهت دو دنباله را نتیجه گرفت.در ماتریس دو پروتئین عینا موسوی قطر اصلی ماتریس توسط نقطه‌ها پر میشود و هرگونه حذف و اضافه در عناصر دنباله‌ها باعث اختلال در قطر اصلی می‌گردد. علاوه بر قطر اصلی ممکن است قطر‌های دیگری در ماتریس توسط نقطه‌ها ایجاد شود که نشان دهندهٔ شباهت‌های محلی یا بخش‌های تکراری در دنباله‌است.به دلیل محدود بودن الفبای پروتئین‌ها بسیاری از بخش‌های منطبق ممکن است اتفاقی رخ داده باشند. یک راه برای کاهش انطباق‌های اتفاقی این است که فقط قطر‌های چندتایی را در ماتریس نگاه داشته، باقی را حذف کنیم (مثلا قطرهای سه تایی).این کار موثر است چون احتمال اتفاقی بودن انطباق سه عنصر پشت سر هم در دنباله، بسیار کمتر از انطباق یک عنصر است.

رسم نقطه‌ای یکی از راه‌های قدیمی مقایسه دو دنباله است که یک دنباله در محور x ‌ها و دیگری در محور y‌ها قرار میگیرند.هنگامی که دو عنصر از دنباله‌ها یکسان باشند در درایهٔ متناظر با آنها نقطه‌ای رسم می‌شود. توجه داشته باشد که دنباله‌ها میتوانند به صورت جلورو (مستقیم) یا عقبرو (معکوس) روی محورها قرار بگیرند.در این صورت هر دو دنباله باید در یک جهت انتخاب شوند. همچنین توجه داشته باشد که جهت دنباله‌ها روی محور، جهت خط‌ها را در ماتریس تعیین میکند.

ویژگی‌های خاصی مانند انتقال فریم‌ها، تکرار مستقیم و تکرار معکوس روی ارتباط بین نقاط تاثیر میگذرد. انتقال فریم‌ها شامل حذف، اضافه و جهش می‌باشد.

نمونه

مثالی از مقایسه دو دنباله پروتئینی از رسم نقطه‌ای:

1. درایه‌های متناظر با عناصر یکسان در محور‌ها نقطه گذاری شده‌اند.
2. قطرهای دوتایی و سه تایی نگاه داشته شده‌اند.
3. مسیر بهینه در ماتریس مشخص شده‌است.

منابع

• مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا، «Dot plot»، ویکی‌پدیای انگلیسی، دانشنامهٔ آزاد (بازیابی در 27 ژوئن 2011).
• http://www.scribd.com/doc/17727/complete-notes-on-Bioinformatics

پیوند به بیرون

• A tutorial
• Genomdiff — an open source Java Dot Plot program for viruses
• Gepard
• ANACON — Contact analysis of dot plots.
• General introduction to dot plots with example algorithms and a software tool to create small and medium size dot plots.
• Dotlet — provides a program allowing you to construct a dot plot with your own sequences.

.

نمودار جعبه‌ای